荧光具有专注性，一般都比激起光弱，为能观察到专注的荧光，在物镜后边需加阻断滤光片。它的作用有二：一是挑选并让特异的荧光透过，表现出专注的荧光颜色。二是吸收和阻挡激起光进入目镜、以免于扰荧光和损害眼睛，两种滤光片必须挑选配合使用。
奥林巴斯荧光显微镜的基本构造是由一般光学显微镜加上一些附件的基础上组成的。荧光光源—般采用超高压汞灯(50一200W)，它可宣布各种波长的光，但每种荧光物质都有一个产生荧光的激起光波长，所以需加用激起滤片，仅使一定波长的激起光透过照耀到标本上，而将其他光都吸收掉。每种物质被激起光照耀后，在极短时间内发射出较照耀波长更长的可见荧光。
现在，奥林巴斯荧光显微镜使用200W高压汞灯作为光源，其由石英玻璃构成，所述中间球形，汞必须的填充量，里面的，当两个电极之间的放电操作，造成汞蒸腾，快速增加压力球，当汞*蒸腾，可达标准大气压下，该过程一般需要约5?15分钟。超高压汞灯的发光是电极间放电使水银分子水平不断进行解离和复原研究过程中可以发射光量子的结果。它发出强紫外线和蓝紫光，足以激发各种荧光物质，因此，广泛用作全自动荧光显微镜。
在早期的使用新的高压水银灯的可以在没有高电压被点亮，利用一定的时间，必须推出一个高压(约15000V)，在发射后，维持动作电压通常为50?60V，操作约约4A的电流。200W超高压汞灯的平均使用寿命，在每次学生使用2h的情况下企业约为200h，开动一次工作时间越短，则寿命愈短，若开一次只工作20min，则寿命不断降低50%。
因此，在使用时推出，以尽量减少次数。灯泡可以在使用过程中，其光效是逐步开始降低的。当灯灭时，等待冷却重新启动。灯点亮不立即关闭，以避免损坏汞电极之后不*蒸腾，等等一般需要15分钟。由于我国超高压汞灯压力具有很高，紫外线强烈，因而灯泡必须置灯室中方可点着，避免出现损伤保护眼睛。
