倒置荧光显微镜和普通显微镜一样，主要包括三部分：机械部分、照明部分、光学部分。其物镜与照明系统颠倒，在载物台之下。这样的构造使得照明聚光系统与载物台的有效距离可以显著扩大，便于放置培养皿、细胞培养瓶等较厚的待观察器具(当然载玻片等也可以)，而同时物镜与材料之间的工作距离不必很大。
倒置荧光显微镜是激发光从物镜向下落射到标本表面，即用同一物镜作为照明聚光器和收集荧光的物镜。光路中需加上一个双色束分离器，它与光轴呈45°角，激发光被反射到物镜中，并聚集在样品上，样品所产生的荧光以及由物镜透镜表面、盖玻片表面反射的激发光同时进入物镜，反回到双色束分离器，使激发光和荧光分开，残余激发光再被阻断滤片吸收。如换用不同的激发滤片/双色束分离器/阻断滤片的组合插块，可满足不同荧光反应产物的需要。此种荧光显微镜的优点是视野照明均匀，成像清晰，放大倍数愈大荧光愈强。
下面咱们来了解下倒置荧光显微镜的操作方法：
1、常用的观察方法就是相差。由于这种方法不要求染色，是观察活细胞和微生物的理想方法。在此提供各种聚光器来满足需要，这种方法提供带有自然背景色的、高对比度的、高清晰度的图像。
2、开机，接连电源，打开镜体下端的电控开关。
3、使用
(1)准备：将待观察对象置于载物台上。旋转三孔转换器，选择较小的物镜。观察，并调节铰链式双目目镜，舒适为宜。
(2)调节光源：推拉调节镜体下端的亮度调节器至适宜。通过调节聚光镜下面的光栅来调节光源的大小。
(3)调节像距：转三孔转换器，选择合适倍数的物镜;更换并选择合适的目镜;同时调节升降，除或减小图像周围的光晕，提高了图像的衬度。
(4)观察：通过目镜进行观察结果;调整载物台，选择观察视野。
4、关机
取下观察对象，推拉光源亮度调节器至Z暗。关闭设备开关，并断开电源。旋转三孔转换器，使物镜镜片置于载物台下侧，防止灰尘的沉降。
